Além de Faculdades também foram implantadas Instituições científicas e tecnológicas como:
1845:Observatório Nacional;
1838/1862/1869/1894/1900:Institutos Históricos e Geográficos;
1884:Santa Casa de Misericórdia de São Paulo;
1886: Instituto Geológico 5 (Comissão Geográfica e Geológica de São Paulo);
1887: Instituto Agronômico de Campinas (Imperial Estação Agronômica de Campinas) ;
1894:Instituto Florestal (Horto Florestal de São Paulo);
1892: Instituto Bacteriológico;
1893:Escola Politécnica;
1899:Instituto de Pesquisas Tecnológicas (IPT).